丑四证六根即真妄元密令选根门圆通
阿难白佛言：“世尊！如来虽说第二义门，今观世间解结之人，若不知其所结之元，我信是人终不能解。世尊！我及会中有学声闻，亦复如是。从无始际，与诸无明俱灭俱生，虽得如是多闻善根，名为出家，犹隔加疟，惟愿大慈哀愍沦溺！今日身心云何是结？从何名解？亦令未来苦难众生，得免轮回，不落三有”。作是语已，普及大众五体投地，雨泪翘诚，伫佛如来无上开示。尔时、世尊怜愍阿难及诸会中诸有学者，亦为未来一切众生为出世因，作将来眼。以阎浮檀紫金光手摩阿难顶，即时十方普佛世界六种震动，微尘如来住世界者，各有宝光从其顶出，其光同时于彼世界来只陀林灌如来顶。是诸大众得未曾有！于是阿难及诸大众，俱闻十方微尘如来异口同音告阿难言：“善哉！阿难！汝欲识知俱生无明，使汝轮转生死结根，唯汝六根更无他物。汝复欲知无上菩提，令汝速证安乐解脱寂静妙常，亦汝六根更非他物”！阿难虽闻如是法音，心犹未明，稽首白佛：“云何令我生死轮回，安乐妙常，同是六根更非他物”？佛告阿难：“根、尘同源，縳、脱无二，识性虚妄，犹如空华。阿难！由尘发知，因根有相，相见无性同于交芦。是故汝今，知见立知即无明本；知见无见斯即涅槃无漏真净。云何是中更容他物”？
尔时、世尊欲重宣此义，而说偈言：“真性有为空，缘生故、如幻；无为无起灭，不实、如空华。言妄显诸真，妄、真同二妄。犹非真、非真，云何见所见？中间无实性，是故若交芦。结解同所因，圣凡无二路。汝观交中性，空有二俱非。迷晦即无明，发明便解脱。解结因次第。六解一亦亡。根选择圆通，入流成正觉。陀那微细识，习气成暴流，真非真恐迷，我常不开演。自心取自心，非幻成幻法。不取无非幻，非幻尚不生；幻法云何立？是名妙莲华，金刚王宝觉、如幻三摩提，弹指超无学。此阿毗达磨，十方薄伽梵，一路涅槃门”。
论曰：此摄上章根尘识心应时销落……则非一非六之真觉耳。
案曰：古禅德云：“在眼曰见，在耳曰闻，在鼻曰嗅，在舌曰尝，在身曰觉，在意曰知；悟者知是佛性，不语祗弄精魂”。用此以观今经“汝欲识知俱生无明，使汝轮转生死结根，唯汝六根更无他物（精魂）；汝复欲知无上菩提，令汝速证安乐解脱寂静妙常，亦汝六根更非他物（佛性）”。“是故汝今知见立知即无明本（精魂）；知见无见斯即涅槃无漏真净（佛性）”。“陀那微细识，习气成瀑流，真非真恐迷，我常不开演。自心取自心，非幻成幻法（精魂）；不取无非幻，非幻尚不生，幻法云何立（佛性）”！不灿然甚明乎？此皆依如来藏藏识直显如来法身德者。盖但将陀那识之一精明映发在门头者，谓之六根。而此识精之元明，既即缘所遗之清净体，即此明元之精识，又为能生诸缘之攀缘性也。翻覆唯在一手，真妄祗在一心，此为本经一贯之旨。六十佛位皆依此立，故曰：“是名妙莲花、金刚王宝觉、如幻三摩地，弹指超无学。此阿毗达磨，十方婆伽梵，一路涅槃门”也。此独大乘不共之殊胜法门也”。解结因次第，六解一亦亡；根选择圆通，入流成正觉”。则是“汝今欲令见、闻、觉、知，远契如来常、乐、我、净，应当先择死生根本，依不生灭圆湛性成，以湛旋其虚妄灭生，复还元觉得元明觉，无生灭心为因地心”者也。此门则许通于出世三乘者也。“根、尘同源，缚、脱无二，识性虚妄，犹如空华！阿难！由尘发知，因根立相，相见无性同于交芦”。“真性有为空，缘生故、如幻；无为无起灭，不实、如空华。言妄显诸真，妄、真同二妄；犹非真非真，云何见所见？中间无实性是故若交芦。结解同所因，圣凡无二路。汝观交中性，空有二俱非，迷晦即无明，发明便解脱”。此同显如来藏以开圆悟，是大乘般若之宗旨。故昔梵士大乘空宗清辨论师、尝宗此中之第一偈造掌珍论二卷。“真性有为空，缘生故、如幻；无为无起灭，不实、如空华”；以遍荡一切有为无为诸法皆毕竟空也。此偈有二因明比量：真性二字，是宗上寄言区别之名，以示别是宗本真性而说，是故如此。若依俗谛而说，则无为之不生灭法与有为之生灭法，又皆应许有故也。举其比量之式如下：
┌有为法是空──宗。以缘生故──因。如幻──喻。
若依真性而说┤
└无为法不实──宗。无起灭故──因。如空华──喻。
真性犹云真理，亦云胜义。以示原与随顺世间流俗之说不同，故他人不得举世俗之说以斥之也。第一偈则立真以空“有为无为诸法”为妄；第二偈更进一步以空此“破妄之真”亦妄。然则真与非真犹且不立，何况见、所见之根尘有为法哉？要皆缘生无起灭，不实如空华者耳。何结、何解？何圣、何凡？在縳但因迷晦，发明便成解脱。所谓理则顿悟，乘悟并销者也。详观此中九颂，端为大佛顶首楞严一经之蕴陀南，如有心乐总持之士，但专诵此三十六句之文，其功德等于诵持全经咒；以此即是大神咒、大明咒、无上咒、无等等咒故
丑五借结巾明六解一亡即渐解而喻修圆通伦次
于是阿难及诸大众，闻佛如来无上慈诲，祇夜伽陀杂糅精莹，妙理清彻，心目开明，叹未曾有。阿难合掌、顶礼白佛：“我今闻佛无遮大悲、性净妙常真实法句，心犹未达六解一亡舒结伦次；惟垂大慈，再愍斯会及与将来，施以法音洗涤沈垢”！即时如来于师子座，整涅槃僧，敛僧伽黎，揽七宝儿，引手于儿，取劫波罗天所奉华巾，于大众前绾成一结。示阿难言：“此名何等”？阿难、大众俱白佛言：“此名为结”。于是如来绾叠华巾，又成一结，重问阿难：此名何等”？阿难、大众又白佛言：“此亦名结”。如是伦次绾叠华巾，总成六结。一一结成，皆取手中所成之结持问阿难：“此名何等”？阿难、大众，亦复如是次第詶佛：“此名为结”。佛告阿难：“我初绾巾；汝名为结，此叠华巾先实一条，第二第三云何汝曹复名为结”？阿难白佛言：“世尊！此宝叠华缉绩成巾，虽本一体。如我思惟：如来一绾得一结名，若百绾成终名百结。何况此巾祗有六结，终不至七，亦不停五？云何如来祗许初时，第二、第三不名为结”？佛告阿难：“此宝华巾，汝知此巾元止一条，我六绾时名为六结。汝审观察：巾体是同，因结有异。于意云何？初绾结成名为第一，如是乃至第六结生，吾今欲将第六结名成第一不”？“不也，世尊！六结若存，斯第六名终非第一。纵我历生尽其明辩，如何令是六结乱名”？佛言：“如是，六结不同，循顾本因一巾所造，令其杂乱终不得成。则汝六根亦复如是，毕竟同中生毕竟异”。佛告阿难：“汝必嫌此六结不成，愿乐一成复云何得”？阿难言：“此结若存，是非锋起，于中自生此结非彼，彼结非此。如来今日若总解除，结若不生，则无彼此，尚不名一，六云何成”？佛言：“六解一亡，亦复如是，由汝无始心性狂乱，知见妄发，发妄不息，劳见发尘。如劳目睛，则有狂华。于湛精明无因乱起；一切世间山河大地，生死涅槃，皆即狂劳颠倒华相”。阿难言：“此劳同结，云何解除”？如来以手，将所结巾偏掣其左，问阿难言：“如是解不”？“不也，世尊”！旋复以手偏牵右边，又问阿难：“如是解不”？“不也，世尊”！佛告阿难：“吾今以手左右各牵，竟不能解，汝设方便云何解成”？阿难白佛言：“世尊！当于结心，解即分散”。佛告阿难：“如是，如是！若欲除结，当于结心。阿难！我说佛法从因缘生，非取世间和合粗相。如来发明世出世法，知其本因随所缘出，如是乃至恒沙界外一滴之雨亦知头数，现前种种松直、棘曲、鹄白、乌玄皆了元由。是故阿难！随汝心中选择六根，根结若除，尘相自灭；诸妄销亡，不真何待！阿难！吾今问汝：此劫波罗巾六结现前，同时解萦得同除不”？“不也，世尊！是结本以次第绾生，今日当须次第而解。六结同体，结不同时，则结解时云何同除”？佛言：“六根解除，亦复如是。此根初解，先得人空；空性圆明，成法解脱；解脱法已俱空不生，是名菩萨从三摩地得无生忍”。
论曰：此蹑上章六解一亦亡……越世出世间，其余如文。
论曰：丁、六结不同，一巾所造……我已示汝劫波罗巾，何所不明！
丑六敕众圣说余门同证广耳门而密授圆通本根
论曰：此请圆通本根，正第二决定义……入佛乘正定聚耳。
论曰：己、本经始终唯令得就佛乘……大旨可见。
案曰：由是观之，全经无非十方如来得成菩提妙奢摩他、三摩、禅那最初方便审矣。此科今按经文，应更分析为二。
寅一阿难请世尊授圆通本根
阿难及诸大众蒙佛开示，慧觉圆通，得无疑惑。一时合掌、顶礼双足而白佛言：“我等今日，身心皎然，快得无碍。虽复悟知一六亡义，然犹未达圆通本根。世尊！我辈飘零，积劫孤露，何心何虑预佛天伦，如失乳儿忽遇慈母！若复因此际会道成，所得密言还同本悟，则与未闻无有差别？惟垂大悲惠我秘严，成就如来最后开示”！作是语已，五体投地，退藏密机，冀佛冥授。
寅二世尊敕众圣说最初悟门
卯一世尊普敕
尔时、世尊普告众中诸大菩萨及诸漏尽大阿罗汉：“汝等菩萨及阿罗汉，生我法中得成无学。吾今问汝：最初发心悟十八界，谁为圆通？从何方便入三摩地”？
卯二众圣各陈
辰一众圣略说余门
巳一音声圆通
憍陈那五比丘即从座起，顶礼佛足而白佛言：“我在鹿苑及于鸡园，观见如来最初成道，于佛音声悟明四谛。佛问比丘，我初称解；如来印我名阿若多。妙音密圆，我于音声得阿罗汉。佛问圆通，如我所证音声为上”。
案曰：此方真教体，清净在音闻。所余法门皆藉音声彰显，故以音声居首。皆归闻根受持，故以闻根殿后。始音终闻，所由圆摄此方之真清净教体者也。得多闻阿难之人，修观音旋闻之行，洵宏传释尊遗教者不二门哉。
巳二色因圆通
优波尼沙陀即从座起，顶礼佛足而白佛言；“我亦观佛最初成道，观不净相，生大厌离，悟诸色性，以从不净、白骨、微尘归于虚空；空色二无，成无学道。如来印我名尼沙陀。尘色既尽，妙色密圆，我从色相得阿罗汉。佛问圆通，如我所证色因为上”。
巳三香严圆通
香严童子即从座起，顶礼佛足而白佛言：“我闻如来教我谛观诸有为相。我时辞佛，宴晦清斋，见诸比丘烧沉水香，香气寂然来入鼻中。我观此气，非木、非空、非烟、非火，去无所著，来无所从，由是意销，发明无漏，如来印我得香严号，尘气倏灭，妙香密圆，我从香严得阿罗汉。佛问圆通，如我所证香严为上”。
巳四味因圆通
药王、药上二法王子，并在会中五百梵天即从座起，顶礼佛足而白佛言：“我无始劫为世良医，口中尝此娑婆世界草木、金石，名数凡有十万八千。如是悉知苦、醋、碱、淡、甘、辛等味，并诸和合、俱生、变异。是冷、是热，有毒、无毒，悉能遍知。承事如来，了知味性非空非有，非即身心、非离身心。分别味因，从是开悟，蒙佛如来印我昆季药王、药上二菩萨名，今于会中为法王子。因味觉明，位登菩萨。佛问圆通，如我所证味因为上”。
巳五触因圆通
跋陀婆罗并其同伴十六开士，即从座起，顶礼佛足而白佛言：“我等先于威音王佛闻法出家，于浴僧时随例入室。忽悟水因，既不洗尘，亦不洗体；中间安然，得无所有。宿习无忘，乃至今时从佛出家，令得无学。彼佛名我跋陀婆罗。妙触宣明，成佛子住。佛问圆通，如我所证触因为上”。
巳六法因圆通
摩诃迦叶及紫金光比丘尼等即从座起，顶礼佛足而白佛言；“我于往劫，于此界中有佛出世名日月灯，我得亲近闻法修学。佛灭度后供养舍利，然灯续明，以紫光金涂佛形像。自尔已来，世世生生身常圆满紫金光聚，此紫金光比丘尼等即我眷属，同时发心。我观世间六尘变坏。唯以空寂修于灭尽，身心乃能度百千劫犹如弹指。我以空法成阿罗汉，世尊说我头陀为最。妙法开明，销灭诸漏。佛问圆通，如我所证法因为上”。
巳七旋见圆通
阿那律陀即从座起，顶礼佛足而白佛言：“我初出家常乐睡眠，如来诃我为畜生类。我闻佛诃，啼泣自责，七日不眠，失其双目。世尊示我乐见照明金刚三昧，我不因眼观见十方，精真洞然如观掌果，如来印我成阿罗汉。佛问圆通，如我所证，旋见循元斯为第一”！
巳八反息圆通
周利槃特迦即从座起，顶礼佛足而白佛言：“我阙诵持，无多闻性，最初值佛闻法出家，忆持如来一句伽陀，于一百日得前遗后，得后遗前。佛愍我愚，教我安居调出入息。我时观息，微细穷尽，生、住、异、灭，诸行刹那，其心豁然得大无碍，乃至漏尽成阿罗汉，住佛座下印成无学。佛问圆通，如我所证，反息循空斯为第一”！
巳九旋知圆通
憍梵钵提即从座起，顶礼佛足而白佛言：“我有口业，于过去劫轻弄沙门，世世生生有牛齝病。如来示我一味清净心地法门，我得灭心入三摩地，观味之知非体非物，应念得超世间诸漏。内脱身心，外遗世界，远离三有，如鸟出笼；离垢销尘，法眼清净，成阿罗汉，如来亲印登无学道。佛问圆通，如我所证，还味旋知斯为第一”！
巳十纯觉圆通
毕陵伽婆蹉即从座起，顶礼佛足而白佛言：“我初发心从佛入道，数闻如来说诸世间不可乐事。乞食城中，心思法门，不觉路中毒刺伤足，举身疼痛。我念有知，知此深痛，虽觉觉痛，觉清净心无痛痛觉。我又思惟：如是一身宁有双觉？摄念未久，身心忽空；三七日中诸漏虚尽，成阿罗汉，得亲印记，发明无学。佛问圆通，如我所证，纯觉遗身斯为第一”！
巳十一旋法圆通
须菩提即从座起，顶礼佛足而白佛言；“我旷劫来心得无碍，自忆受生如恒河沙。初在母胎即知空寂，如是乃至十方成空，亦令众生证得空性。蒙如来发性觉真空，空性圆明得阿罗汉，顿入如来宝明空海。同佛知见，印成无学，解脱性空我为无上。佛问圆通，如我所证：诸相入非，非所非尽，旋法归无，斯为第一”！
巳十二心见圆通
舍利弗即从座起，顶礼佛足而白佛言：“我旷劫来心见清净，如是受生如恒河沙，世出世间种种变化，一见则通，获无障碍。我于中路逢迦叶波兄弟相逐，宣说因缘，悟心无际，从佛出家。见觉明圆，得大无畏，成阿罗汉，为佛长子。从佛口生，从法化生。佛问圆通，如我所证，心见发光，光极知见，斯为第一”！
巳十三心闻圆通
普贤菩萨即从座起，顶礼佛足而白佛言：“我已曾与恒沙如来为法王子，十方如来教其弟子菩萨根者修普贤行，从我立名。世尊！我用心闻分别众生所有知见，若于他方恒沙界外，有一众生心中发明普贤行者，我于尔时乘六牙象，分身百千皆至其处。纵彼障深未得见我，我与其人暗中摩顶，拥护安慰，令其成就。佛问圆通，我说本因，心闻发明，分别自在，斯为第一”！
巳十四息观圆通
孙陀罗难陀即从座起，顶礼佛足而白佛言：“我初出家从佛入道，虽具戒律，于三摩地心常散动，未获无漏。世尊教我及俱絺罗观鼻端白。我初谛观经三七日，见鼻中气出入如烟，身心内明，圆洞世界，遍成虚净，犹如琉璃。烟相渐销，鼻息成白，心开漏尽；诸出入息化为光明，照十方界，得阿罗汉，世尊记我，当得菩提。佛问圆通，我以销息，息久发明，明圆灭漏，斯为第一”！
巳十五辩才圆通
富楼那弥多罗尼子即从座起，顶礼佛足而白佛言：“我旷劫来辩才无碍，宣说苦、空，深达实相，如是乃至恒沙如来秘密法门，我于众中微妙开示，得无所畏。世尊知我有大辩才，以音声轮教我发扬。我于佛前助佛转轮。因师子吼成阿罗汉，世尊印我，说法无上。佛问圆通，我以法音降伏魔怨，销灭诸漏，斯为第一”！
巳十六持戒圆通
优波离即从座起，顶礼佛足而白佛言：“我亲随佛踰城出家，亲观如来六年勤苦，亲见如来降伏诸魔、制诸外道，解脱世间贪欲诸漏。承佛教戒，如是乃至三千威仪、八万微细性业、遮业，悉皆清净。身心寂灭，成阿罗汉。我是如来众中纲纪，亲印我心，持戒修身众推为上。佛问圆通，我以执身身得自在，次第执心心得通达，然后身心一切通利，斯为第一”！
巳十七神力圆通
大目犍连即从座起，顶礼佛足而白佛言：“我初于路乞食，逢遇优楼频螺、伽耶、那提三迦叶波，宣说如来因缘深义。我顿发心，得大通达。如来惠我袈裟著身，须发自落。我游十方得无挂碍，神通发明推为无上，成阿罗汉。宁唯世尊，十方如来叹我神力，圆明清净自在无畏。佛问圆通，我以旋湛心光发宣，如澄浊流久成清莹，斯为第一”！
巳十八火大圆通
乌刍瑟摩于如来前，合掌顶礼佛之双足而白佛言；“我常先忆久远劫前，性多贪欲。有佛出世名曰空王，说多淫人成猛火聚。教我遍观百骸、四肢、诸泠暖气；神光内凝，化多淫心成智慧火。从是诸佛皆呼召我名为火头。我以火光三昧力故，成阿罗汉。心发大愿，诸佛成道我为力士，亲伏魔怨。佛问圆通，我以谛观身心暖触无碍流通，诸漏既销生大宝焰，登无上觉，斯为第一”！
巳十九地大圆通
持地菩萨即从座起，顶礼佛足而白佛言：“我念往昔普光如来出现于世，我为比丘。常于一切要路津口，田地险隘，有不如法妨损车马，我皆平填。或作桥梁，或负沙土。如是勤苦，经无量佛出现于世。或有众生于阛闇处要人擎物，我先为擎，至其所诣放物即行，不取其直。毗舍浮佛现在世时，世多饥荒，我为负人，无问远近唯取一钱。或有车牛被于泥溺，我有神力为其推轮，拔其苦恼。时国大王延佛设斋，我于尔时平地待佛。毗舍如来摩顶谓我：当平心地，则世界地一切皆平！我即心开，见身微尘，与造世界所有微尘等无差别，微尘自性不相触摩，乃至刀兵亦无所触。我于法性悟无生忍，成阿罗汉，回心今入菩萨位中，闻诸如来宣妙莲华佛知见地，我先证明而为上首。佛问圆通，我以谛观身界二尘等无差别，本如来藏虚妄发尘，尘销智圆成无上道，斯为第一”！
巳二十水大圆通
月光童子即从座起，顶礼佛足而白佛言：“我忆往昔恒河沙劫，有佛出世名为水天，教诸菩萨修习水观入三摩地。观于身中水性无夺，初从涕唾，如是穷尽津液精血、大小便利，身中旋复水性一同；见水身中，与世界外浮幢王刹诸香水海、等无差别。我于是时初成此观，但见其水，未得无身。当为比丘室中安禅。我有弟子窥窗观室，唯见清水遍在室中，了无所见。童稚无知，取一瓦砾投于水内，激水作声，顾盼而去。我出定后顿觉心痛，如舍利弗遭违害鬼。我自思惟：今我已得阿罗汉道，久离病缘，云何今日忽生心痛？将无退失？尔时、童子捷来我前，说如上事。我则告言：“汝更见水，可即开门入此水中，除去瓦砾”。童子奉教，后入定时，还复见水，瓦砾宛然，开门除出。我后出定，身质如初。逢无量佛，如是至于山海自在通王如来，方得亡身；与十方界诸香水海，性合真空，无二无别。今于如来得童真名，预菩萨会。佛问圆通，我以水性一味流通，得无生忍，圆满菩提，斯为第一”！
巳二一风大圆通
琉璃光法王子即从座起，顶礼佛足而白佛言：“我忆往音经恒沙劫，有佛出世名无量声，开示菩萨本觉妙明，观此世界及众生身、皆是妄缘风力所转，我于尔时观界安立，观世动时、观身动止、观心动念、诸动无二，等无差别。我时觉了此群动性，来无所从，去无所至；十方微尘颠倒众生，同一虚妄。如是乃至三千大千一世界内所有众生，如一器中贮百蛟蚋啾啾乱鸣，于分寸中鼓发狂闹。逢佛未几，得无生忍；尔时心开，乃见东方不动佛国，为法王子，事十方佛。身心发光，洞彻无碍。佛问圆通，我以观察风力无依，悟菩提心，入三摩地，合十方佛，传一妙心，斯为第一”！
巳二二空大圆通
虚空藏菩萨即从座起，顶礼佛足而白佛言：“我与如来定光佛所，得无边身。尔时手执四大宝珠，照明十方微尘佛刹化成虚空。又于自心现大圆镜，内放十种微妙宝光。流灌十方尽虚空际，诸幢王刹来入镜内，涉入我身。身同虚空不相妨碍，身能善入微尘国土，广行佛事，得大随顺，此大神力，由我谛观四大无依，妄想生灭，虚空无二，佛国本同。于同发明，得无生忍。佛问圆通，我以观察虚空无边入三摩地，妙力圆明，斯为第一”！
巳二三唯识圆通
弥勒菩萨即从座起，顶礼佛足而白佛言：“我忆往昔经微尘劫，有佛出世名日月灯明。我从彼佛而得出家，心重世名，好游族姓。尔时、世尊教我修习唯心识定，入三摩地。历劫已来，以此三昧事恒沙佛，求世名心歇灭无有。至然灯佛出现于世，我乃得成无上妙圆识心三昧；乃至尽空如来国土，净秽有无，皆是我心变化所现。世尊！我了如是唯心识故，识性流出无量如来。今得授记，次补佛处。佛问圆通，我以谛观十方唯识，识心圆明入圆成实，远离依他及遍计执；得无生忍，斯为第一”！
巳二四念佛圆通
大势至法王子与其同伦五十二菩萨，即从座起，顶礼佛足而白佛言：“我忆往昔恒河沙劫，有佛出世名无量光，十二如来相继一劫，其最后佛名超日月光。彼佛教我念佛三昧：譬如有人，一专为忆，一人专忘，如是二人若逢不逢，或见非见。二人相忆，二忆念深，如是乃至从生至生，同于形影不相乖异。十方如来邻念众生，如母忆子，若子逃逝，虽忆何为！子若忆母如母忆时，母子历生不相违远。若众生心忆佛念佛，现前当来必定见佛，去佛不远。不假方便自得心开。如染香人，身有香气，此则名曰香光庄严。我本因地，以念佛心入无生忍。今于此界，摄念佛人归于净土，佛问圆通，我无选择，都摄六根净念相继，得三摩地，斯为第一”！
案曰：上众圣略说余门竟。