【愿文四】
〖铁佛寺礼忏文〗（壬午）
菩萨戒沙弥智旭，自惟障重不逢盛时，目击时艰，倍增愀怆，斗米几及千钱。已叹民生之苦，病死日以千计。尤惊业报之深，良由同分恶缘，感此非常幻相，了知心外无法，何容坐视漠然？兹遇盂兰道场，然香五炷，供养法界三宝。发五种愿：一愿当今皇帝，宽裕温柔，尊贤容众。视臣犹如手足，膏泽彻于寰区。用慈心三昧，降伏魔军。以无作四弘，绍隆佛种；二愿檀越道府某某，广及当朝宰辅，海内群臣，各得仕学无虞，明威有实；三愿苕溪境内，震旦国中，疾疫消除，刀兵寝息，风雨顺时，谷稼丰稔，广兴法化，同出苦轮；四愿我等各各师僧父母，历劫亲缘，善恶知识，同学眷属，造寺檀越，十方信施，无不超越四流，圆证三德，自利究竟，利他遍周；五愿尽虚空界，抱识含灵，等悟真因，咸成妙果，空九界之梦幻，归一心之本源。尘尘物物，无非寂光。法法头头，显发妙行。遍微尘国，不闻魔外之名，尽未来时，不起爱见之浊。恭惟法界三宝，证知护念。
〖甲申七月三十日愿文〗
归命能仁无上尊，大孝大慈真法性。
三乘权实众威神，愿赐哀怜垂摄受。
弟子智旭，自惟夙障，缠此幻形。复以深愆，丁兹劫浊，三写乌焉？悲佛法之衰乱，五逆横作。痛国步之艰难，朝野无改过之心。缁素争覆辙之践，良由共识相种，恶业同牵，同分妄见，眚缘共起，彻底思惟，决无心外实境。由衷悔憾，须勤体内沤和。爰与同行，并集檀那，普为国王帝主、父母亲缘、土境万民、法界含识，顶礼慈悲道场忏法，供养历代知识道容。然香三炷，供常住三宝。又三炷，奉供幽冥教主地藏慈尊，伏愿大行皇帝，灭毁像之重尤，解杀戮之积怨，顿蒙解脱，速悟无生。今日主臣，进贤远佞，发真实悲救兆民之心，捐利去名，竭真实不顾身家之悃。次愿我等各各生身父母、历劫亲缘、师友知识、眷属檀护等。已命过者，长辞八难，托质九莲；今现在者，不受兵祲，永离惊慑。又愿执劳运力助营福业者，一念无私，共转国家之祸乱，三轮不昧，等消君父之愆亡。又愿见闻随喜，广及法界众生，普植良因，等成妙种。空五浊之幻染，证三德之性真，尽虚空界，悉悟圆常。智旭乃当，成等正觉。
〖佛菩萨上座忏愿文〗
顶礼十方大威德，五分严身慈勇王。
以不思议本誓愿，同赐哀怜拔济我。
弟子智旭，敬然顶香三炷，供养十方法界，去来现在无穷无尽一切三宝。剖沥肝心而自责曰：呜呼！从古解超佛祖之前，行落凡庸之后，殆未有甚于罪旭者也。智旭，于未识佛时，未识法时，未识僧时，误听邪师，妄以千古理学自任，造无量谤三宝罪，应堕阿鼻大地狱中，具受阿僧祗劫剧苦。蒙观音、地藏二大士力，种种感触，拔我邪心，令得归向佛法，正信出家。不谓出家后，仍被夙业所障，仅发解慧，不沾法流。复因损己利人，遂致心欲定而反乱，念欲净而偏染。二十余年，略无实诣。今者反躬无似，内省多愆。念及生死事大，无常迅速，真堪恸地号天，追思剃染初心，离俗本志，何啻断肠裂胆？外无化他之实，内妨自行之功，在世既溺邪见浊流，出家又为法门污道，进退失措，惭憾何穷？窃思向年力诟大士，大士尚自哀怜。今已深信三宝，三宝宁弗摄受？只由无始障浓，自隔同体悲应。然障无实法，惟心所生。既从心生，还从心灭，而理障必须理除，事障应须事遣。自惟多生以来，急乘缓戒，薄事尚理，久堕三涂。偶获暂出，所以一闻宗教，彻底知归。力学毗尼，偏多违犯。圆顿妙理，无精细而不入。相好观门，虽少分而罔成。既揣病源，理须良药，曾闻造像功德，最能灭罪除愆。礼拜忏摩，实可洗心涤虑。爰发虔诚，集资改造一佛二菩萨像，仍发誓愿，恒礼占察行法，不论年月。专祈纯善轮相，众生虽垢重，诸佛不厌舍，必以大慈悲，哀愍度脱我。使我从今以后，心无掉举，身得轻安，护口过而勿出绮语恶言，净意地而不起杂思欲觉，速得清净三轮，克臻自他二利，普化众生，同生净土。
〖大悲行法道场愿文〗（乙酉五月初三日）
顶礼真实大悲心，究竟分证二觉者。
我无始来堕虚妄，循环生死靡暂停。
失本性乐枉受苦。今欲与拔自无力。
愿大威神同体缘，不舍本誓垂哀济。
弟子智旭，自惟旷大劫来，言不顾行，口与心违。今虽幸厕缁流，仍不能忘故辙。简点一生，有六大罪，而小过盖无数焉。明知向上一路，而不能亲到佛祖真受用处；明知圆顿教观，而不能登五品以净六根；明知大小毗尼，而不能清净性遮诸业；明知杀业是刀兵劫因，而杀机尚未永忘；明知偷盗是饥馑劫因，而偷心尚未全断；明知淫欲是疫病劫因，而淫机尚自炽然。是以别业资乎同分，现行感于共种，睹三灾之洊臻，悲四生之无赖，徒怀旷济之心，反受俱溺之害，扪心自憾，血泪何裨？今幸遇济生禅院大悲心咒行法道场，发心随众熏修。愿涤自他尘垢，适值母难之辰，敬然顶香六炷，供十方法界佛、法、僧宝，极乐教主阿弥陀佛，大悲心咒总持秘要，千手千眼观音大士。发六种愿：一、干戈永息。二、五谷丰稔。三、兆民正信三宝。四、灵峰古刹复兴。五六、智旭多生恶习，速得克除，烦恼脂消，功德圆满，及永无意外逆顺二缘，早完阅藏著述二愿。又然臂香十炷，供十方三宝，发十种愿：一、期主净障；二、同行成器；三、香灯侍者事理齐修；四、外坛同行戒乘俱急；五、常住一切职事执劳运力助缘营福者，不落有漏；六、一切护法宰官、舍财檀越，深悟解脱；七、一切见闻随喜，若缁若素遇影蒙尘，功无虚弃，永为道种，速证圆常；八、灵峰住山沙门，及某等早得清净轮相，圆成福慧二严，深念苦空，专求出要；九、三涂息苦，八难超升，蠕动蜎飞，均沾胜益；十、以前功德，回向西方，普与含灵，同生净土。
〖礼千佛告文〗
弟子智旭，与法界含识，自从无始至于今生，昧我法本空，起遍计情执，具迷事迷理二种无明，作分段变易二死根本。贪嗔痴慢，邪见纷纭，杀盗淫欺，饮啖颠倒。依于三业六根，广造五逆十重，致使三涂鼎沸，八苦云攒。乃至幸获人身，仍遭劫浊。疾疫饥荒洊至，已足寒心。干戈兵革频兴，尤堪丧胆。父母妻孥莫保，骨肉身首分离。百骸溃散，谁思一性常灵？万鬼聚号，肯信三缘自召？悠悠长夜，泪与血而俱枯。漠漠荒郊，魂与魄而奚泊？哀哉同体之痛，惨矣切肤之悲！憾道力未全，徒怀凄怆。思拯援无策，只裂肺肝。爰鸠同志，五体投诚，代为大地被难众生顶礼三劫三千诸佛，臂然香炷，心发菩提。仰愿大悲拔苦，大慈鉴机，大智慧光，烁群盲之积暗。大神通力，出苦海之沉沦。令今日海内海外、江北江南已命过者，速脱九横之城，径超九莲之土。未命过者，即离惊窜之怖，永享太平之安。又愿诸佛菩萨，兴慈运悲，悯此劫波，来膺众许。又愿遇影蒙尘，蜎飞蠕动，广及法界一切有情。从今已去，乃至菩提，常知警悟，不构恶缘，永灭三涂，顿消八苦。即同居而横彻寂光，不僧祗而圆登妙觉。
〖祖堂结大悲坛忏文〗
顶礼大悲尊，及法界三宝。
不厌垢众生，始终垂哀拯。
智旭，自惟无始来至于今日，积恶逾于须弥，招苦浮于大地。虽蒙诸佛菩萨种种提携，薄解真乘，无奈夙业烦恼渊渊深厚，时牵现行。盖无论未归信前，厥罪无量。即追思既出家后，愆累尤多。如大悲行法道场，业五与胜会，乃杂乱障垢，终不与三昧相应，虚消檀信脂膏，辜负人天属望，抚心扼腕，惭惧何穷？兹又恭遇幽栖禅寺，建清净坛，施主竭供养之诚，期主极殷重之悃。智旭以下劣凡夫，沙门污道，不惟叨陪法席，兼复谬主行仪，反躬无似，惊悚弥增。爰于方便结界之始，敬然臂香三炷，奉供大悲同体三宝。又三炷，供九位同行忏师，伏愿同体三宝，悯智旭之沉沦，速垂拔济。同行九人，悯智旭之不逮，咸赐匡扶。俾一期中，内障外扰以潜消，理观事仪皆成就。智旭又于十方三世三宝前，现在同行九人前，胡跪合掌，剖肝沥血，作如是白：智旭从无始来，至于前世，所有种种烦恼恶业苦报，无明覆故，已不自忆，今悉忏悔，愿尽消除；智旭少年谤三宝业，今尚忆知，诚心忏悔，愿尽消除；智旭出家已来，挂菩萨比丘虚名，不能如法行持，所有性遮诸罪，若忆不忆，无量无边，今悉忏悔，愿尽消除。智旭于四十六岁，自反多愧，退作但三归人，勤礼千佛万佛及占察行法。幸蒙诸佛菩萨大慈大悲，于今年正月元旦，锡以清净轮相，稍自慰安。无奈夙习根深，不能自拔。出坛后又起种种身口意业，乃至济生庵修大悲行法，然香忏悔以后，默简长夏初秋，仍复多诸违犯。呜呼！佛称二种健儿。一自不作罪；二作已能悔。夫作已能悔者，必悔已不更作，故可称健儿也。数数悔，又数数犯，岂健儿乎？智旭，今犹坠厕人，身、口、耳、鼻，皆陷粪中。独明信因果，不谤大乘，清净正眼，未没溺耳。设诸佛菩萨，现前善友，不乘此时力拯拔之，正恐淹渍日久，清净正眼并从沦隐，可不哀哉！智旭反复自思，本以真实为生死心，决定大菩提心，绝不夹带利名，亦不牵染恩爱，如法出家。因地颇正，胡为堕落至此？久滞凡地，不预圣流。即欲逃名晦迹，独往深山，筋力渐衰，不堪行迈。且爱见慈悲，漫萦缠于婆和学侣，致使枉寻直尺，担麻弃金，如此痛伤，惟诸佛菩萨能知。亦唯有诸佛菩萨能救耳。且向年力诋三宝，惟有罪障，诸佛菩萨尚自矜怜。今日宏通大乘，亦有微善，诸佛菩萨岂反终弃邪？是以披揭愚衷，仍求加被，愿我烦恼脂消，功德肉肥，三学圆明，二严满足。舍此幻躯，决生极乐，尽未来际，广度群迷。又愿同行九人，各各克除习气，成就总持，自利利他，栋梁法厦。又愿期主福慧增长，檀越信行坚固，乃至随喜缁素，执劳运力，见影闻声，悉悟显密圆通，咸了性修不二，直至菩提，不遭岐曲。又愿风调雨顺，物阜民安，干戈息而烽火无惊，疾疫除而医药无用。菽粟如水火，陌路犹至亲，挽末劫颓风，不异正法住世，超娑婆浊恶，同归安养莲胎。
〖占察行法愿文〗（丙戌）
归命慈威无等尊，拔苦与乐真出要。
定力能除三劫灾，救世真士垂悲拯。
弟子智旭，痛念劫浊难逃，刀兵竞起。虽云同分妄见，实非无因误招，往业莫追，来事可谏。爰偕同志某等（十人）各捐净资，营修供养，三日方便，七日正修，如法结清净坛，顶礼占察行法，六时行道，五悔炼心，哀吁同体大悲，恳乞无缘拔济，伏念众生障垢，虽至重至深，三宝洪慈，终不厌不舍。苟一念知改过，必随许以自新。况释迦本师，勇猛称最；地藏大士，誓愿无忘。子幼弱父爱偏强，儿不肖母怜益甚，悯兹匍匐入井之愚，赐以身手衣裓之用。俾毫光照处，消兵戈为瑞日祥云，法雨沾时，转邪蘗为道芽灵种。所愿风调雨顺，国泰民安，正教流通，魔邪窜绝。次祈比丘智旭，身无病苦，心脱结缠，定与慧而等持，戒并乘而悉净，期主某法社虽复三年，摄护愿如一日，某等各各真为生死，发菩提心，克除习气，臻修法门，三学圆成，二严克备，续佛慧命，普利人天。又祈外坛随喜缁素，悟知一实，开显三因，二观圆修，三忍圆证。又祈外护助缘，广及法界含识，若见若闻，若不闻见，等植良因，均沾胜益。又祈江北江南，乃至震旦域内，近日遭兵难者，种种债负消除，一一怨嫌解释，脱幽冥之剧苦，胎莲萼以超升，恭干法界三宝，地藏圣师，真实证知，真实摄受。
〖大悲坛前愿文〗
归命顶礼十方常住三宝、大悲观世音菩萨、地藏菩萨摩诃萨，伏祈同赐哀怜，俯垂拔济，切惟智旭，向于九华拈得阅藏著述一阄，遂复安心，重理笔砚。适于祖堂轮现，所患命尽之语，理应并意，径驰乐邦。独可痛者，阅藏未完，则私愿未满，教观无继，则法轮无传。且《梵网》《佛顶》，虽已竭一隙之明，如尘培岳，而《棱伽》《唯识》，犹复锢繁言之障，如雾迷空。自非假我数年，何以了兹陈债？自非洪慈庇护，安能不扰他缘？敬然臂香十炷，供养十方慈父、大悲观音、地藏本尊、法界三宝，伏愿智旭，从今以去，永离违缘，决定阅完大藏，得成《阅藏知津》、《法海观澜》二书。决能撰述《成唯识论》、《观心法要》及《相宗八要直解》，决能解释《棱伽》尊经及《占察十轮》度世要典。决能阐明《无量寿会》、《弥陀贤护》、《净土津梁》。决能发畅《大般涅槃》，扶律谈常，最后垂范。又愿学侣，乃至现在未来诸有志者，决能戒根永净，福慧圆成，寿命延长，解行双到。又愿智旭，烦恼冰熔，智慧火炽，十恶根枯，六情性露。又愿万民无三灾之苦，四姓伐邪见之林。又愿以此功德，普施法界众生，临命终时，决定得生阿弥陀佛极乐世界，亲承供养大悲观音，得无量无边三昧神通，总持智慧，同地藏慈尊，普入法界诸大地狱，救度一切苦恼众生，乃至分形散体，横遍竖穷，十界现身，三轮施化，如一众生未成佛，终不于此取泥洹。
〖阅藏毕愿文〗（甲午九月初一日）
敬礼无边际，去来现在佛。
等空不动智，救世大悲尊。
弟子智旭，敬然臂香四炷，供养尽十方三世一切诸佛、一切尊法、一切菩萨、一切圣贤，痛念智旭，年三十幻寓龙居，第二阅律。遂复发心遍阅大藏，于一夏中，仅阅千卷。旋以事阻，至三十三岁，甫进灵峰，结冬时山中无藏，癸酉春藏至未装。丙子季春遁迹九华，于彼抱病，阅千余卷。壬午山中藏装成。癸未结制，简阅仅千余卷。又被他缘所牵，幻寓祖堂，及石城北，共阅二千余卷。己丑归山，因注《法华》《占察》二经，改治律要，未遑展阅。壬辰秋，拟进山毕兹夙愿，又值幻缘牵至长水，借阅千卷，直至今甲午春，方获归卧林泉。又以一夏病缘居半，乃于仲秋月毕，仅获完满。窃计发心看藏，已经二十七年，出入兹山，亦匝二十三载，凡历龙居、九华、漳州、泉州、祖堂、石城、长水、灵峰八处，方获竣事。于中前后阅律三遍，大乘经两遍，小乘经及大小论，两土撰述，各止一遍而已。呜呼！缅想法缘不易，可胜涕泗滂沱。今幸仗三宝力，已毕微愿。是以然香更求加被，一者窃见南北两藏，并皆模糊失次，或半满不辨，或经论互名，或真伪不分，或巧拙无别。虽有宋朝法宝标目，明朝汇目义门，并未尽美尽善。今辄不揣，谬述《阅藏知津》、《法海观澜》二书，倘不背佛旨，乞得成就流通；二者如《圆觉》《维摩》《弥陀》《地藏》乃至《大涅槃经》，夙有微愿，再加解释，并《僧史》《宝训》，亦愿增修，仰求庇护，令得速成；三者大殿半倾，前殿尽倒，触目伤心，实难为力。今以付与天龙，愿蚤成就；四者念此荒野之地，久不闻佛法名，实赖大楫法主、大粹静主、大颀期主，以创其端。至于请藏，则戒周首发大心，道晋、如源等助成其美。印刷则受筹之功。装潢则心见之力。苦守不坠，则成琼为最。助缘成就，则善信是资。伏愿已上过去者，以今然香功德，三障顿消，四生永脱，莲开上品之华，佛授一生之记。现在者道心坚固，福德增长，寿命延长，智慧开发。又愿学人（六人）及堂内堂外上下静室一切法眷，各各克除习气，趣向菩提，戒定慧以增明，福寿康而如意。又愿智旭，从今以去，病苦消除，烦恼冰释，不遭逆顺两魔，恒得安心著述，以兹法施功德，回向西方净土，普与法界众生，同生极乐世界。
〖大病中启建净社愿文〗（十二月十三日）
甲午十二月十有三日，菩萨戒弟子智旭，一心归命极乐世界阿弥陀佛，观世音、大势至清净海众，及十方三世一切三宝。痛念智旭，本为生死大事，二十四岁出家，绝无半点好为人师之念，不意幻缘所逼，谬为人师。二十余年，虽有弘法微善，而虚名所累，观行荒疏，弗能折伏烦恼，以登五品。今病患缠身，心虽明了，力不自由，痛哭号呼，罔知攸措，幸仗佛慈，残喘未绝。设非急勖净业，何以永脱苦轮？爰发虔心，敬就灵峰藏堂，邀同志法侣（十人）及外护菩萨沙弥（五人）和合一心，结社三载，每日三时课诵，称礼洪名，二时止静，研穷大藏，教观双修，戒乘俱急。愿与法界众生，决定同生极乐。智旭从今以去，誓不登座说法，除同志执经问义不敢倦答。若敷文演义，自有照南灵晟性旦，略可宣传。誓不背佛平坐，除稍偏及对像坐。誓不登坛授戒，若授戒学律，自有照南等慈可以教授。誓不应在家人请斋，除寺院静室中。仰乞三宝证明摄受，令智旭诸缘未尽，早就轻安，大限难逃，径归安养。生则念佛兼著述，死则不堕亦不退。又愿同行法侣，无论旭存与否，坚志同修，有始有卒。又愿外护沙弥，无论旭存与否，诚心营事，勿懈勿失。以此殊胜净因，回向无上极果，普与含生，咸归秘藏。
灵峰蕅益大师宗论卷第一之四