【正文】既能于道上除妄，繼之則為清淨妄心成本覺。此中有二次第，即加行與正行。
首述加行。當于道上修持之際，能熟習甚深法義，則行者自能當妄念生起時，于境中令之清淨。能令本覺顯現者，厥為心意之自性光明，即所謂于本覺境界清除妄念。
【釋義】甚深法義者，即指外密與內密。尤特指大瑜伽、無比瑜伽、無上瑜伽之生起次第及圓滿次第。行者可藉此體驗本覺。實相本覺智有五，即大圓鏡智等。若于此五者迷而不覺，則生妄念，此際之妄心即是五毒。故五毒實為相對于五智之迷誤而已。若行者能覺，則五毒即自然清淨為五本覺智。而為妄念听障之心識本體光明，亦自能顯現。
上來為加行法之簡述。下文分述進一步之道上法要。
【注釋】小乘修習，重點在除煩惱，如對治觀；大乘顯宗修習，于對治外，重點在知煩惱之空性；密乘修習，重點在轉煩惱為菩提心，或逕即煩惱即菩提，此則為大圓滿修習。
此述密乘之加行，即于猶未能即煩惱即菩提時，已能藉所修法，于境中自行體驗清淨五毒煩惱之自性光明。然此際尚有法執，尚有能所及取舍，故非究竟，僅為加行耳。
【正文】更進則可依其所修，分為共道、不共道、無上道。分別為以對治法門清淨迷誤妄心；或使之轉化，于本覺界中轉為清淨；或不舍妄念，而妄念自能融回本位而成覺。
無論行者作何種修持，用何法門清淨，妄念之止滅及還淨，究無二致。
【釋義】顯教為共道，分小乘大乘。小乘又有聲聞及緣覺二道。大乘則為菩薩道。小乘之消除妄心，視之如毒，舍棄唯恐不及。大乘則用對治，如修慈以對治嗔心，修白骨觀及膿血觀以對治貪欲，修緣起以對治無明。
不共道即外內密乘。用不共修法使妄念轉化及淨化，且以此種修習為道。例如，生起次第于生起之清淨境中，五蘊成五部佛頂，五毒成本尊之五智等。于圓滿次第中，行者以相應之正念化解五毒，使之轉化，于是五毒即消融于修所成身之脈氣點中。如修拙火生起大樂以化解貪欲，修幻化身知其非實以化解嗔心，修夢光明以化解無明愚痴等。
無上道即大圓滿，行者由修習上述諸法，逐步體認，終能駕御妄心。即能悟知妄念，當其生起時，彼即自然消融于本位，一如水面之畫。是故妄念不必舍棄，能知諸法空相，證入本覺，妄念即自行消除而得清淨。
由于妄心究竟無自性，不能尋覓，故無論用何法消除，究無二致。其于本覺中或止滅、或還淨，畢竟相同。水面之畫本隨生隨滅，故不必理會用何法門將之磨滅也。
【正文】若能悟知生起貪嗔痴慢妒五毒之自性，彼即自然平息，且自然還滅，清淨為五根本智。
【釋義】所悟生起妄心之自性，或謂之曰本來面目，即能悟其真實空性。依勝義言，妄心了不可得。因其自行生滅，如水面之畫，故實無生無住無滅。迷而不知其本體，則宛然真實，若知其所以，則不須整治，妄心自行平息。一如水波自行平息于水中。既不能實知能平息波浪者為何，亦不能實知所平息者究竟為何。于此喻中，波喻妄念妄心，水喻自心本體。是故知妄心之本體，即知與其相應之本覺智，彼等即于本覺中還淨而滅。
舉例而言，若知貪欲之本體，此貪欲為對事物生喜悅而思佔有，即應知此妄念實為妙觀察智之本體。換言之，由知貪欲自性，即知所執非為實有。如是作，即令此曾觀察事物，且曾追逐事物之本覺智顯露。貪欲由是即于此妙觀察智中還淨。
然此卻非妄念先行生起，本覺智隨後生起以平息之。妄心妄念實起滅同時，悟其本體則覺，迷即成妄。迷其本體則染，悟即清淨。
復次，亦非先知妄心本體，妄心隨後始于本覺中消融。譬如，並非黑夜之暗先行消失，然後白晝之光隨後而至。若謂其如是者，則白晝便無須紅日，蓋黑暗已于紅日升起前消失。故光現則暗消，覺顯則妄除，二者實同時者也。迷與覺之分別，僅視其能否于一切法空性中清淨而已。執為實有，覺即為此執所暗，此即妄心所生之妄念，能清淨此執者，即本覺智耳。
【注釋】本節所述，僅為不共道法門，即轉煩惱為菩提。外密及內密初二瑜伽屬之。下文言淨五毒成五智，即其詳述。唯仍未言及大圓滿道。大圓滿則視此僅為加行。
【正文】于加行中，五毒妄心清淨成五智。其名為妙觀察智、大圓鏡智、法界體性智、平等性智、成所作智。
【釋義】貪欲者，為接觸一法，對此法即能生悅樂，故貪欲實涵蓋其余妄心。舉例而言，如對嗔心之貪，其嗔恨心之回應，無非為求離諸憎惡而已。對痴欲之貪，則為對事物之迷戀起執著。能淨此種對一法一境之固執者，蓋唯妙觀察智。此智能料簡一法而不涉其余，且能悟其空性知非實有。
嗔心乃對覺其厭惡者而發，此種反應，唯用大圓鏡智清淨，知所厭者亦本自清淨明徹。此智之義，為能澄清而非障礙，換言之，此智能無礙清楚反映諸法，故其本質為澄明。
痴欲者，實一暗境，于境中視物不清，亦復無知。一如貪欲，痴亦能涵蓋余妄。唯用法界體性智加以清淨。此智不落見地，對空性赤裸裸證悟。
有等上師釋嗔痴二法之對應智，恰恰相反，即以法界體性智清淨嗔心，以大圓鏡智清淨痴欲。此實無須爭論，蓋五智實相互周普者。如妙觀察智、大圓鏡智、法界體性智、平等性智、成所作智五者，皆法界體性智之支分，余亦同之。因知五智互攝，而非互斥。
慢心者，自視較人為勝，若地位、家境、財富、智慧等。平等性中無高下分別之妄心，無好丑，無內外，故此智即能無對待差別，由是慢心即無由生起。此智即如是清淨妄心。
成所作智者，于所作能隨意成辦而無礙，可清淨妒念，蓋于此妄念中，唯求他人不能成辦事業，而己則能之。
此即于解脫道上本覺中清淨妄心之加行法門。下來說勝義清淨，亦即佛道。
【注釋】五方佛為五智之體性，密乘修習，轉五蘊為五方佛，復轉五毒為佛之五智。茲分述如下。
色蘊轉成不動佛，佛為大圓鏡智體性，能轉痴心。一說能轉嗔心。
識蘊轉成毗盧遮那佛，佛為法界體性智體性，能轉嗔心，一說能轉痴心。
受蘊轉成寶生佛，佛為平等性智體性，能轉慢心。
想蘊轉成無量光佛，佛為妙觀察智體性，能轉貪心。
行蘊轉成不空成就佛，佛為成所作智體性，能轉妒心。
【正文】若勝義，當自廣大佛性中清除污染，則自能得平靜無染之圓滿境界。此境界本體法爾呈現。佛之三身、法身，一味、本覺，皆具無比清淨之空性身耳。此境唯佛能知。
【釋義】佛性空廣，自然清淨，且遍一切諸佛及有情，雖有情因污染而生障，亦具佛性。行者見空性自行生起，而妨礙解脫之妄念則消融其中，此際即悟佛性。此性又復能生清淨，如是即能清淨無染。此二清淨，有如經磨光之金塊，本已清淨，因磨去暗晦而更清淨。
此種對佛性完全認知之境界，即所謂空界體。雙重清淨，亦即佛之證悟境。由不同觀點視之，佛則有三身。法身佛即唯一味，得本覺智。大圓滿者，即三種佛身之圓滿境界，能自然圓滿。法身佛能滿足行者之目的，其余兩種身則滿足其他方面，彼此不但互不妨擾，且唯一味，彼等于本覺智境界中，唯一法爾，不可分割，且成圓滿。
【注釋】《入中論》雲︰“如器有異空無別，諸法雖別性無差，是故正智同一味，妙智剎那達所知。”此言諸法無我性唯是一味，故佛位之一切種智，于一剎那即能通達法界萬有之理。謂三身一味者，其理如是。
【正文】佛之三身，即法身、報身、化身。三身皆具本覺，且契合自性法身。此身過去現在未來三世常恆，周蟮^猜 拚 拗危 轡抻斜湟住７ 縞硭 擼 慈繅獗χ椋 幢揪豕Φ攏 蘢鞅ㄉ砑盎 硎鞠幀４碩 磧幟蓯鞠治 畹仄腥 爸鈑星欏Ｈ淮宋ㄖ罘鷥杏αΓ 八 袒 星櫓 埔擔 擼 緩笫寄蘢魘鞠幀Ｂ只匚純眨 罘鴯Φ錄賜 繅饈魅繅庵椋 月 磺杏星櫓 浮４思次 詒揪踔辛鍆 牡檬ひ邇寰弧 br />
【釋義】自性法身為諸佛常恆實相，周𧎚衚D蟹鶘恚 移鹺弦磺蟹鶘磯 煥胍 ４思幢揪踔巧懟Ｆ淥嬉聳鞠鄭 次 罘鴯Φ攏 硪月 磺杏星樵福 等鞜筧輾⑸涔食 ４松磧卸 幢ㄉ磧牖 懟１ㄉ矸鸞魷蚱腥 魘鞠鄭 腥 擼 殉嗦懵闃と 招裕 簧凶Σ腥 壞刂潦 亍； 矸鷦螄蚍步纈星槭鞠鄭 弒 木灰狻Ｒ蝗綾κ 鹿饉 眨 怨餉 滴 鹿庥氡κ 猓 史鶘磧詵ㄉ 障嘀惺鞠鄭 滴 鷸 杏αΓ 壩星檣埔刀 擼 Φ輪 刪停 從詒揪踔辛鍆 氖ひ邇寰弧 br />
【注釋】菩薩十地，即第一歡喜地，第二離垢地，第三發光地，第四焰慧地，第五極難勝地，第六現前地，第七遠行地，第八不動地，第九善慧地，第十法雲地。詳見《入中論》闡明。
大圓滿所修明體，即內證智體，本自光明，即是法身。然亦由法身示現種種身。本節即釋其理。
大圓滿法唯重內證，若能證見內證智境，妄心即剎那法爾還淨，故無思量計度。視其余諸道，皆執妄相以求不妄之佛果，故勝。
【正文】願駕七騎之大日，即上來所說甚深義，以千光明，即上來所說句義，普照諸弟子國土，于其心意晴空，為一切有情照破無明暗。