鉴真在日本，讲授佛学理论，传播博大精深的中国文化，促进了日本在佛学、医学、建筑和雕刻水平等方面的提高，受到中日两国人民和佛学界的尊敬。
郭沫若赞美鉴真的诗
鉴真盲目航东海，
一片精诚照大清，
舍己为人传道艺，
唐风洋溢奈良城。
从诗中可以深切的感受到，人民对鉴真的无比崇敬和尊重。
评价·佛教
鉴真在日本首次建立起了严格的戒律制度，使得日本佛教走上正轨，便利了政府对佛教的控制，杜绝了由于疏于管理而造成的种种弊端，促使佛教被确定成为日本的国家宗教。鉴真和其弟子所开创的日本律宗也成为南都六宗之一，并主持修建了唐招提寺，流传今日，尚有余辉。
评价·医药.书法.绿温石.日本料理
鉴真熟识医方明，当年光明皇太后病危之时，唯有鉴真所进药方有效验。据日本《本草医谈》记载，鉴真只需用鼻子闻，就可以辨别药草种类和真假，他又大力传播张仲景的《伤寒杂病论》的知识，留有《鉴上人秘方》一卷，因此，被誉为“日本汉方医药之祖”。按照日本汉方野崎药局主席野崎康弘的说法，以下36种药草都是鉴真带往日本推动使用的[1]：
麻黄、细辛、芍药、附子、远志、黄芪、甘草、苦参、当归、柴胡、川芎、玄参、地黄、紫苏、丹参、黄芩、桔梗、旋覆花、苍术、知母、半夏、芜花、栀子、五味子、黄柏、杏仁、乌药、厚朴、和厚朴、肉桂、杜仲、唐木瓜、大枣、蜀椒、花椒、吴茱萸
鉴真及其弟子在书法方面也有很深的造诣，他在第六次东渡之时，携带了王羲之的行书真迹一幅（丧乱帖）、王献之的行书真迹三幅，以及其他各种书法50卷。这对日本书道的形成起到了极大的促进作用。鉴真本人也是书法名家，其“请经书贴”被誉为日本国宝。
据传，753年鉴真的弟子在东渡时带去了一种四川靠近西藏的绿石头，唐贞元二十年（804),日本僧人空海大师来唐学法，在长安青龙寺从惠果大师受金刚界、胎藏界两部秘法，并受传法大阿闍黎位。3年后回国也带上很多绿石经板。
日本僧人因得到一块很有灵性的绿石头如获至宝。多年后绿石头在日本演变为禅僧的温石，称其为“绿温石”。
现在日本人做菜的习惯称为"日本料理"。按照字面的含义来讲：料包含着计量，理包含着盛器，就是把料配好的意思。日本菜系中，最早最正统的烹调系统是"怀石料理"，距今已有四百五十多年的历史。据日本古老的传说，"怀石"一词也是由禅僧的"温石"而来。那时候，修行中的禅僧必须遵行的戒律是只食用早餐和午餐，下午不吃饭。可是，年轻的僧侣耐不住饥饿和寒冷，将加热的石头包于碎布中称为"温石"，揣到怀里，顶住胃部以耐饥寒。后来逐步发展为少吃一点东西，起到"温石"御饥寒的作用。
后世纪念
鉴真在中、日两国都享有很高的声誉。当其去世的消息传回扬州的时候，扬州僧众全体服丧三日，并在龙兴寺行大法会，悼念鉴真。在日本，鉴真也享有国宝级人物的待遇。1963年是鉴真去世一千二百年，中国和日本佛教界都举行了大型纪念活动，日本佛教界还将该年定为“鉴真大师显彰年”。1980年，在邓小平的斡旋之下，唐招提寺住持森木孝顺奉鉴真漆像“回乡探亲”，扬州大明寺因此得以重修，成为中日邦交史上一件大事。