药师法门依据《药师经》而建立。此土所译《药师经》有四种：
（一）《佛说灌顶拔除过罪生死得脱经》一卷，即《大灌顶神咒经》卷十二，东晋帛尸梨蜜多罗译。又相传有刘宋慧简译《药师琉璃光经》一卷今已佚失，或云即是东晋所译之《灌顶经》。
（二）《佛说药师如来本愿经》一卷，隋达摩笈多译。
（三）《药师琉璃光如来本愿功德经》一卷，唐玄奘译。此即现今流通本所据之译本。现今流通本与原译本稍有不同者有增文两段，一为依东晋译本补入之八大菩萨名，二为依唐义净译本补入神咒及前后文二十余行。
（四）《药师琉璃光七佛本愿功德经》二卷，唐义净译。前数译惟述药师佛，此译复增六佛故云《七佛本愿功德经》，以外增加之文甚多。西藏僧众所读诵者为此本。
修持之法具如经文所载，今且举四种如下：
（一）持名，经中屡云闻名持名因其法最为简易其所获之益亦最为广大也。今人持名者皆曰“消灾延寿药师佛”似未尽善，佛名惟举‘药师’二字未能具足。佛德惟举‘消灾延寿’四字亦多所缺略，故须依据经文而曰“药师琉璃光如来”斯为最妥善矣。
（二）供养，如香华旛灯等。
（三）诵经，及演说开示书写等。
（四）持咒。
所获利益广如经文所载，今且举十种如下：
（一）速得成佛，经中屡言之。
（二）行邪道者令入正道，行小乘者令人大乘。
（三）能得种种戒，又犯戒者还得清净不堕恶趣。
（四）得长寿富饶官位男女等。
（五）得无尽，所受用物无所乏少。
（六）一切痛苦皆除，水火刀兵盗贼刑戮诸灾难等悉免。
（七）转女成男。
（八）产时无苦，生子聪明少病。
（九）命终后随其所愿往生：
1、人中，得大富贵。
2、天上，不复更生诸恶趣。
3、西方极乐世界，有八大菩萨接引。
4、东方净琉璃世界。
（十）在恶趣中暂闻佛名即生人道修诸善行速证菩提。
灵感事迹甚多如旧录所载，今且举近事一则如下：
泉州承天寺觉圆法师，于未出家时体弱多病，既出家后两年之内病苦缠绵诸事不顺。后得闻药师如来法门，遂专心诵经持名忏悔，精勤不懈，迄至于今，身体康健，诸事顺利。法师近拟编辑药师圣典汇集，凡经文疏释及仪轨等，悉搜集之，刊版流布，以报佛恩焉。
跋
曩余在清尘堂讲药师如来法门，后由诸善友印施讲录，其时经他人辗转钞写，颇有讹误。玆由觉圆法师捐资再版印行，请余校正原稿，广为流布。法师出家以来，于药师法门最为信仰，近拟于泉州兴建大药师寺，其愿力广大，尤足令人赞叹云。
沙门一音